Die Mikrobiota spielt eine wichtige Rolle bei der Modulation des Immunsystems. Störungen der Darmmikrobiota, d. h. Dysbiose, können zu einer Funktionsstörung dieser Prozesse führen und das Risiko für multiple entzündliche und Autoimmunerkrankungen erhöhen. Diese Dysbiose-induzierte Immundysregulation wird durch Studien gestützt, die zeigen, dass Patienten und Patientinnen mit diesen Krankheiten Mikrobiota-Profile aufweisen, die sich von gesunden Probanden unterscheiden. [5] Auch der Zusammenhang zwischen Dysbiose und Allergie ist gut belegt. Beobachtende Studien haben ergeben, dass eine Störung der Darmbesiedelung im frühen Leben, zum Beispiel durch Kaiserschnitt, frühes Abstillen oder fehlendes Stillen, zu veränderten Mikrobiota-Profilen und einer erhöhten Inzidenz von allergischen Erkrankungen führen kann. [6]